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測(cè)序試劑盒的捕獲具體步驟

更新時(shí)間:2025-04-02 點(diǎn)擊次數(shù):644
測(cè)序試劑盒的捕獲步驟通常指的是在基因組測(cè)序過(guò)程中,如何從樣本中選擇和富集特定的目標(biāo)區(qū)域。捕獲步驟通常與目標(biāo)區(qū)域捕獲(TargetedCapture)技術(shù)相結(jié)合,主要用于高通量測(cè)序(NGS)中,通過(guò)選擇性地捕獲特定DNA片段以提高分析的靈敏度和準(zhǔn)確性。下面是捕獲步驟的概述:  
1.樣本準(zhǔn)備  
首先,需要從樣本中提取DNA。樣本可以是血液、組織、唾液等,提取過(guò)程會(huì)根據(jù)不同的樣本類型選擇不同的提取方法。提取后的DNA會(huì)被質(zhì)控,以確保其質(zhì)量和完整性滿足后續(xù)實(shí)驗(yàn)的要求。  
2.DNA片段化  
為了便于后續(xù)的捕獲和測(cè)序,提取到的DNA需要經(jīng)過(guò)片段化。這一步驟通過(guò)物理(例如超聲波破碎)或酶切(如限制性內(nèi)切酶)的方法將DNA分解成適合捕獲的小片段。  
3.目標(biāo)區(qū)域設(shè)計(jì)與探針合成  
根據(jù)研究的需要,選擇目標(biāo)區(qū)域(例如特定基因、外顯子或其他感興趣的序列)。然后,合成與這些目標(biāo)序列互補(bǔ)的探針。探針通常是固定在微珠或其他固相支持物上的寡核苷酸序列。這些探針可以與樣本中的目標(biāo)DNA序列特異性結(jié)合。  
4.目標(biāo)區(qū)域富集(捕獲)  
在這一步,添加合成的探針與片段化的DNA進(jìn)行雜交。探針與目標(biāo)區(qū)域序列結(jié)合后,未結(jié)合的非目標(biāo)DNA序列會(huì)被洗脫掉。這個(gè)過(guò)程可以通過(guò)反應(yīng)體系中的條件控制,使目標(biāo)DNA區(qū)域與探針特異性結(jié)合。  
5.洗脫  
捕獲了目標(biāo)序列后,使用洗滌步驟去除非特異性結(jié)合的雜散DNA。通過(guò)一定的鹽濃度和溫度控制,確保只有目標(biāo)DNA區(qū)域被保留下來(lái),而其他無(wú)關(guān)序列被去除。  
6.擴(kuò)增(可選)  
有時(shí),為了提高捕獲序列的量,捕獲后的DNA片段會(huì)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。這一步是為了增加目標(biāo)區(qū)域的信號(hào)強(qiáng)度,以確保后續(xù)測(cè)序的靈敏度。  
7.文庫(kù)構(gòu)建  
捕獲后的目標(biāo)區(qū)域DNA可以直接用于文庫(kù)構(gòu)建。文庫(kù)構(gòu)建過(guò)程中,DNA片段的兩端會(huì)連接適配器,以便后續(xù)的測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行識(shí)別和擴(kuò)增。  
8.測(cè)序  
文庫(kù)構(gòu)建完成后,將其加載到高通量測(cè)序平臺(tái)(如Illumina、BGISEQ等)進(jìn)行測(cè)序,獲取高質(zhì)量的序列數(shù)據(jù)。  
總結(jié)  
捕獲步驟的關(guān)鍵在于目標(biāo)區(qū)域的選擇、探針設(shè)計(jì)以及洗脫過(guò)程,通過(guò)精確的操作,可以確保只富集出感興趣的區(qū)域,從而提高測(cè)序的效率和準(zhǔn)確性。

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